آموزش کار با دستگاه Sequence Analyzer

محتوای کارگاه سکانس:

کارگاه تئوری و علمی در آزمایشگاه

پرسش و پاسخ

ارائه اسلایدها و جزوه‌ها

دسته بندی:

نام استاد: جناب آقای احسان عابدی | سرکار خانم سرمه پورتوکلی

پیش نیازهای کارگاه

پیش نیازهای این دوره عبارت اند از:

آشنایی با اصول  PCR

توضیحات کارگاه

توالی‌یابی سنگر، که به نام توالی‌یابی خاتمه زنجیره نیز شناخته می‌شود، یک روش رایج برای تعیین توالی نوکلئوتیدی DNA است. این روش توسط فردریک سنگر و همکارانش در سال 1977 توسعه یافت و روشی بود که برای پروژه ژنوم انسان استفاده شد.

روش سنگر بر اساس ادغام تصادفی ddNTPs توسط DNA پلیمراز در طول تکثیر DNA در آزمایشگاه است. DNA پلیمراز آنزیمی است که DNA را از یک الگو کپی می کند. هنگامی که یک ddNTP در یک زنجیره DNA در حال رشد ادغام می شود، زنجیره را با جلوگیری از افزودن نوکلئوتیدهای بیشتر متوقف می‌کند.

روش سنگر تا حد زیادی توسط روش‌های توالی یابی نسل بعدی (NGS) که می توانند DNA را بسیار سریع‌تر و با کارایی بالاتر توالی کنند، جایگزین شده‌است. با این حال، سنگر هنوز در برخی کاربردها که دقت و تکرارپذیری بالا نیاز دارند؛ مانند تشخیص بالینی و تشخیص جهش، استفاده می‌شود.

این روش هنوز به طور گسترده‌ای در زمینه‌های تحقیقاتی و بالینی استفاده می‌شود و به احتمال زیاد برای بسیاری از کاربردها تا سال های آینده ادامه خواهد داشت.

 

کاربردهای روش سنگر

سنگر طیف وسیعی از کاربردها را در زمینه های تحقیقاتی و بالینی دارد. از این روش برای موارد زیر استفاده می شود:

تعیین توالی ژن‌ها

شناسایی جهش‌ها

توصیف تنوع ژنتیکی

تشخیص بیماری‌های ژنتیکی

مطالعه تکامل

مقایسه با توالی‌یابی نسل بعدی

سرفصل های کارگاه

سنگرسیکوینسینگ چیست؟ تاریخچه و انواع کاربردها

انجام دادن PCR Cycle نمونه ها

اصول Cycle sequencing و Purification

انجام Purification نمونه های سکانس

آماده سازی نمونه سکانس برای ورود به دستگاه و خوانش

آموزش نرم افزار 3130 Data collection

Fragment چیست؟ آماده سازی نمونه و خوانش نمونه فرگمنت در دستگاه (در صورت موجود بودن)

آموزش نرم افزار Sequence Analysis

مشاهده نمونه های سکانس خوانش شده در نرم افزار

آموزش نرم افزار Genemapper و آنالیز تعدادی نمونه در نرم افزار

آموزش نحوه نگهداری از دستگاه (تعویض بافر، پلیمر، کپیلار، پلیت و …)

انجام PCR Cycle و آماده سازی نمونه سکانس برای ورود به دستگاه

آماده سازی نمونه های فرگمنت برای ورود به دستگاه (درصورت موجود بودن)

مشاهده نمونه های سکانس خوانش شده

آنالیز نمونه های فرگمنت خوانش شده (در صورت موجود بودن، در غیر این صورت نمونه هایی جهت آنالیز داده خواهد شد.)

رفع  اشکال

اهداف کارگاه:

توانمندسازی کارآموز برای کار با دستگاه ژنتیک آنالایزر و حل مشکل

درباره استاد

جناب آقای احسان عابدی

مدیر اپلیکیشن در شرکت آرینا حیات دانش

 

 سرکار خانم سرمه پورتوکلی

کارشناس اپلیکیشن در شرکت آرینا حیات دانش

Reviews

There are no reviews yet.

Be the first to review “آموزش کار با دستگاه Sequence Analyzer”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

Sale!

تعداد جلسات: 15 جلسه

مدت زمان دوره: 200 دقیقه

نحوه برگزاری: حضوری

خدمات